Hösten 1999 och Malmö står inför stora utmaningar: bro till Köpenhamn, ny högskola, eleganta bostadskvarter där Kockums en gång legat. Ironiskt nog sladdar Malmö FF i allsvenskan, det är risk att de ska åka ur. I detta Malmö där nytt bryts mot gammalt hittas den unga Yassemin Said en höstmorgon död i Pildammsparken. Hon har palestinsk bakgrund och har av allt att döma utsatts för ett hedersmord. Hjalmar Lindström på Länskriminalen och polisaspiranten Monica Gren kopplas in på fallet, men de har svårt att komma någon vart. Två av Yassemins kusiner häktas, men misstankarna går också i riktning mot hennes pojkvän Dragan. Det uppdagas dessutom att en före detta pojkvän till henne, Niclas Hjälm, har befunnit sig nära mordplatsen natten då hon berövades livet. Det är inte förrän en ny brutal händelse inträffar som Monica Gren med hjälp av ett hugskott långsamt börjar få förhållandena att klarna. Pojken i eken är en berättelse om en stad i förvandling, en kriminalroman som också är en övertygande samtidsskildring.